Mali mühür tüzel kişinin, yani şirketin kendisinindir ve yalnızca e-fatura, e-arşiv, e-defter gibi mali belgeleri onaylar. e-İmza ise gerçek kişiye aittir; ıslak imzayla yasal olarak eşdeğerdir ve fatura dışında sözleşmeden dilekçeye kadar her türlü elektronik belgeyi imzalar. Pratikte anonim ve limited şirketler genelde mali mühür kullanır; şahıs işletmeleri ile serbest meslek erbabı ise e-belge süreçlerini e-imzayla yürütür.